在知识产权交易市场中，软件著作权和软件专利是专利市场中常见的两种专利。那么知识产权交易市场的这两种专利有什么区别？
      由于计算机软件本身有易复制易改编的特点，而软件的开发又需要耗费大量的人力物力财力，所以复制抄袭成了侵害软件著作权的主要方式。当其投入知识产权交易市场中，若是相关的知识产权保护措施没有做好，是极其容易遭受侵权的。依据《著作权法》的规定，软件的著作权保护的优点非常明显，其有利于保护软件权利人的复制权。而且软件著作权保护使著作权人获得保护的程序简便。只要符合著作权法的要求，几乎所有独立完成的软件都可以受到著作权法的保护。作品的著作权采用自然生效原则，著作权的登记只是获得证据的一种方式，而不是生效条件。
       由于著作权只保护创意的表达，却不保护创意本身，如果对软件只进行著作权保护的话，其他的开发者可以利用已有软件的创作思想并且从中得到启发，研制出新的软件。但是从受保护的软件创作者的角度看，他的成果被别人无偿利用，自己权益受到侵害。这也就是著作权保护的缺陷之处，而软件的专利却能保护保护软件的算法及其思想内容，这些是著作权保护无法比拟的。因而，知识产权交易市场的这两种专利的保护还是有差别的。
       根据《专利法》和《专利法实施细则》的相关规定，我国并没有将计算机软件的软件排除于专利法保护范围之外，如果一件涉及计算机程序的发明专利申请是为了解决技术问题，利用了技术手段和能够产生技术效果，就不能否定该发明专利申请属于可给予专利保护的客体。
       但软件的专利保护也有它自身的缺点，例如，若有申请专利，专利的技术材料就必须公开，而且申请专利需要支付费用，获得专利后每年还需要支付一定的维持费用。 同时，软件开发者申请专利保护需要符合专利的新颖性、创造性、实用性的条件，其对所申请的软件具有较高要求。另外， 专利的申请及审查需要两三年的时间，因此有些软件市场生命周期较短就不适于专利保护。